Seacara geografis Pekon Way Ngison terletak pada posisi 489500 Lintang Selatan dan 9404500 Bujur Timur. Topografi ketingian Desa ini adalah berupa dataran yaitu sekitar 110-130 Mdpl. Berdasarkan data BPS Kabupaten Pringsewu Tahun 2017, selama tahun 2018 curah hujan di Pekon Way Ngison rata-rata mencapai 24-30 mm/hm curah hujan sepanjang 1 Tahun.

Secara Adminstratif Pekon Way Ngison terletak di wilayah Kecamatan Pagelaran Kabupaten Pringsewu dengan posisi dibatasi oleh wilayah Pekon-Pekon tetangga, di sebelah utara berbatasan dengan Pekon Sidodadi dan Gemahripah, di sebelah barat berbatasan dengan Pekon Ranjung Kemala Kecamatan Pugung Kabupaten Tanggamus, di sebelah selatan berbatasan dengan Pekon Tanjung Dalam, sedangkan di sebelah timur berbatasan dengan Pekon Karang Sari.

Jarak tempuh Pekon Way Ngison ke Ibu Kota Kecamatan adalah 8 km 15 menit, sedangkan jarak tempuh ke Ibu Kota Kabupaten adalah 16km yang dapat ditempuh dengan waktu sekitar 30 menit.

Pekon Way Ngison terletak di sebelah selatan sekitar 16km dari Kota Pringsewu dengan batas-batas wilayah sebagai berikut :

Utara          : Pekon Sidodadi dan Gemahripah
Timur          : Pekon Karang Sari
Selatan       : Pekon Tanjung Dalam
Barat          : Pekon Tanjung Kemala Kecamatan Pagelaran Kabupaten Tanggamus.